魏县林业局共设4个行政职能股(室)、七个事业职能股(室)。

魏县林业局为魏县人民政府直属事业机构，是主管林业工作的职能部门。其主要职能：贯彻执行国家关于林业工作的政策法规，研究制定全县林业生态环境建设、森林资源保护、国土绿化、沙荒治理和林业产业发展的规章及政策，组织实施并监督检查，制定全县林业发展战略、中长期发展规划、年度计划并组织实施；实施全县林业工程项目和社会造林工程，监管全县林业资金的使用，指导基层林业工作机构建设；围绕林果生产，搞好技术服务、作业设计、苗木调剂和督导验收工作；负责全县林业资源调查、规划设计、动态监测、统计及管理工作；负责办理林地使用许可证、林木采伐许可证及森林植物、木材及花木、果品、中药材检疫证等；负责监督全县森林资源和林果树木评估结果；实施依法治林，严格限额采伐审批制度；按规定征收育林基金，处理林木纠纷，惩治乱砍滥伐行为，依法保护森林资源，搞好林木病虫害防治和检测预报工作；负责苗木、木材、花木、果品检疫及全县野生动物保护和森林防火工作，指导全县林业执法队伍建设；负责各类商品林及试验林的扶育和管理，围绕提高果品效益，引进名特优新品种，推广普及新技术，抓好苗圃培育工作，搞好全县林业科技、教育和宣传工作，指导全县林业队伍建设。

局内设办公室、计划财务股、人事股3个行政股室，果树站、林政站、林业检疫站3个事业股室。下属魏县苗圃场1个企业单位。编制34人。

一、行政职能股(室)
(一)办公室。负责上通下达，来信来访、综合治理、文秘档案、车辆管理及其它事务；协调业务科室(事业单位)之间的关系，搞好综合业务工作。事业编制3人，股级职数2人。工勤编制1人。
(二)人事股。负责干部考核、奖惩、职称晋升工作；负责人事、工资管理和人事统计工作；负责计划生育、老干部服务等工作。事业编制3人，股级职数2人。
(三)计划财务股。负责组织项目申报，编制项目资金使用计划及项目资金管理；搞好本部门及下属单位的财务管理和国有资产管理，组织实施财会制度，编制财务计划、财务报表和会计决算。事业编制2人，股级职数1人。
二、事业职能股(室)
(一) 果树站。负责全县果品、花卉行业的管理工作；组织实施果品、花卉的结构调整和基地建设；组织指导果品、花卉的品种改良、品质提高和标准化生产工作；指导全省林业产业工作；指导赴境外森林资源开发的有关工作；监督管理果品质量安全；组织实施果品质量安全标准；负责果品产地环境和生产投入品的监管、果品质检机构资质审核认定、无公害产地认定和产品认证、禁止生产区域的调整与划分、果品质量安全监测及信息发布工作。
（二）林业检疫站。参与制定本县区域内林业技术推广计划并组织实施；承担公共所需的林业关键性技术的引进、试验、示范以及适用技术的组装集成与推广；组织推广林业标准化生产和林业产品生产过程中的质量安全检测、监测与强制性检验；组织对林业资源、林果生态环境及林业生产投入品的使用监测；组织林业公用信息及培训教育服务。指导全县林木病虫害防治和检测预报工作，根据林业有害生物发生情况，及时准确地发布预报或警报，提出防治办法和措施，制定突发有害生物事件防治方案并组织实施；负责全部全县林木病虫害防治技术指导、技术咨询，制定防治计划；实施森林植物、木材及花木、果品调运检疫，实施林木种子、苗木和其他繁殖材料的产地检疫，杜绝检疫对象的输入、输出。
（三）林政站。宣传、贯彻党和国家的林业方针、政策，实施依法治林，严格限额采伐。加强对全县的林木经营、加工、运输管理。组织、协调、指导、监督全县森林防火、野生动植物保护和林果树木评估工作。承办上级委托权限范围内林木林地权属行政确认的登记审查。负责本行政辖区内的林权档案管理、统计报表、林权政策上报服务工作。
下属企业单位苗圃场：从事苗木培育，培育各类造林、果树及绿化工程苗木，引进新的良种、新的育苗技术，加快良种苗木培育速度，为本省各市及周边省市提供造林良种苗木。